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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 品牌上线|乳碱化的学渣逆袭哥们,衣康碱化淡化球蛋白组不讲理新一波!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

始终算作煤化工奶茶原料而被熟识的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“新陈代谢废品”成为了“宝藏地方小大分子”的苦不堪言历史进程形似,昨天近二十一两年才被发展其更重要的微植物学功能表,从次“平躺农奴把声乐”,非常是在免疫检测细菌感染病变性重大妇科疾病探析行业内异军突起。不存在几篇研究综述消息了在几种细菌感染病变性重大妇科疾病的宠物模式化中提供给衣康酸或其化学式修饰语衍微生物的医治益处,消息队列展其暗藏靶点。观于衣康酸的“上一世”与“这辈子”,详细软文《乳酸的学渣逆袭朋友——衣康酸!选文兜兜风知晓衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应装饰蛋白酶组学产品,实现1000+举重若轻度呈现位点查出,稳定性逆转有趣靶点,全座向生信探讨解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“知道”到“认可”全具体流程精准服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、實驗工作流程

02、场地实测统计数据

03、经“点”显现

在测试数据源数据源中,验出众多论文中新闻报导的原素靶点下列关于衣康酸体现位点,如第1个被出现 的衣康酸共价体现血清质KEAP1,另外 糖酵解径路中的3个核心酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,并且炎性小体组成的血清质NLRP3和细胞核细胞坏死整个过程中的核心血清质RIPK3等,其质谱图下面图如图所示。

04、车辆优势

1.很多质控

工业化特女性朋友测试探针孵育、SDS-PAGE检测工具工具、WB认可、样版有关的性具体分析等多方面位检测工具工具,加强组织领导建设项目的结果不靠谱性。

2.高效能质谱测量仪器电商平台

在Orbitrap Astral全新一批高辩认质谱仪扶持下,满足衣康酸性反应突显位点及蛋白质检验新宽度,四轮驱动有效研究探讨新看到。

3.全操作流程一趟式贴心服务

为拜谱菌物不断完善的实验报告工作平台,可能提供“神经细胞教育培养→测试探针孵育→WB测量→艰深度衣康碱化呈现测量→独有的生信研究→特殊位点PRM安全验证”全流量服务管理,省时省功更实惠。

05、分享文章(那部分)

06、技术拜谱生物

PART 2、论文资料讲解

专著一

英语怎么说主题词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

2英文大标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

钻研內容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文参考文献二

国外英文小标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常一级标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

探索相关内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例案随之出现想法

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13都具有较少的底物搭配学习能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱怪物衣康酸性反应呈现组测试数据源数据源中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用突显(以下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

看作TCA巡环中的前面消化吸收物,衣康酸的调节消化吸收、抗体和支原体感染之中的上下级能力,为冶疗抗体支原体感染性急病提高了代用冶疗手段。衣康酸架构中的亲电性α,β-不过饱和羧酸架构能对蛋清质上的几丁质酶半胱氨酸残基采取烷基化突显(迈克尔增益发生反应),某些翻译专业后突显被喻为“衣康酸突显(itaconation)”,行而影响力蛋清质技能,调整抗体回复和消化吸收路线,为许多种急病中药科研提高新指导思想。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用遮盖蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学界绝对化一定量靶点分解组(QMT1000)或精力消化吸收转化靶向疗法消化吸收转化组类产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

对比资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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