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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网络上药学学论述草酸钙肾结石氧化反应应激反应和真菌感染破损制度化

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿装置最易见的慢性病一种。肾组织机构中CaOx结晶过达到饱和状态火成岩会促使肾小管神经元断裂和凋亡,然而促使肾结石的引发。短链油脂酸由肠子内水解酸化池疾病发醇营养膳食食物纤维引发,仅仅在轮廓肠子第一道防线中表现效用,而是在装置级别上也表现关键所在效用。中仅,丁酸是最非常丰富的短链油脂酸,体现了免疫性减弱和免疫性减弱效用,本研究综述研究综述丁酸对CaOx肾结石的效用简答内在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医疗泌尿产科吴忠客座教授、周子健硕士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠传授、周子健博土在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱怪物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了互联网临床药理学服务保障,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

经典文章名号:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 消费者部门:华山诊所 深入分析女朋友:大鼠、HK-2神经细胞 分类数据:對照组(Con)、绘图组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱展示 技术应用:网药剂学学加测

思维标准过程流程图

研究方案的结果

学习职工应先实现大鼠类别,完成生活生物化学公式和组织安排方面的问题学染料等学习的方式表明丁酸可以以减少CaOx类别大鼠肾CaOx晶胞的生成和磨损,可以改善CaOx类别大鼠的慢性炎症磨损和腐蚀有害物质的神经太过紧绷表达方式。除外,丁酸还可抑制作用草酸引导的HK-2生殖人体细胞磨损、腐蚀应激性和生殖人体细胞凋亡。 为探索丁酸构成和靶dna互联网,的研究人数从PubChem得到 丁酸和丁酸酯的二维和二维构成(图1A)。使用PharmMapper数剧文件库和Uniprot数剧文件库净化处理后共建立出115个丁酸靶dna供更加骤定量定性数据分析。将dna全部导进STRING数剧文件库,实现PPI互联网定量定性数据分析。Cytoscape已给出了排列的前20的交通联络线站靶dna的全面互联网图,重点包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。以下交通联络线站dna与互联网中的其他的dna均成绩出一定的的相关的于性,阐述以下dna或者会产生着融合做用。GO和KEGG定量定性数据分析阐明了丁酸交通联络线站dna的相关的于方法和怪物学能力(图1C)。交通联络线站dna重点与类固醇抗生素回复、氧化的物应激状态状态回复、吸附性氧生殖细胞对类固醇抗生素激发的症状和对强酸药剂学化合物的症状相关的。结合以上经验,以下交通联络线站dna重点操作了氧化的物应激状态状态和对吸附性氧的怪物症状方式,是肾结石建成管理机制中至关注重的方法,这显示丁酸或者会在肾结石中产生注重做用。

图1| 丁酸设计与靶表观遗传微信网络分折(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进两步探秘丁酸对CaOx肾结石确确实实切靶DNA,的学习方案专业考生管理凭借GEO资料库对GSE73680中安全健康对比与CaOx肾结石病人的DNA差异性做了的学习方案。对比组与CaOx结石病人的特殊力差异性理解DNA(DEGs)检查细则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个DNA情况特殊的变化,在这当中3379个(89.4%)DNA理解调涨,404个(10.6%)DNA理解下降(图2A)。对DEGs做聚类算法阐述阐述,热图提示了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类算法阐述本质特征(图2B)。己经,的学习方案专业考生管理采用GeneCards资料库人工工资评定了370个也许 与CaOx肾结石相应联的DNA,排名第一前20位的推测DNA极其相应联性评判如2C随时。因为看到丁酸缓解CaOx肾结石的核心靶点,的学习方案专业考生管理将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应联DNA清理得见新一个Venn图。后面,CYP2C9被敲定为丁酸印象CaOx肾结石的隐性靶点(图2D)。最后,的学习方案专业考生管理还做了丁酸与CYP2C9的原子连通,CYP2C9的三种氨基酸等残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸之间帮助,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在充分利用网站临床药理学精准预测CYP2C9是丁酸引响CaOx肾结石的靶基因组后,理论研究人还经过血细胞系工作灵魂存在了CYP2C9可消减草酸分析的HK-2血细胞系的ROS技术、支原体感染受伤和凋亡。

图2| 半数以上据库综合浅析预侧CYP2C9是丁酸效果于CaOx肾结石的靶什么是基因

科学研究效果

本调查最先发觉丁酸在机体和机体均能克制CaOx肾结石实体模型的阳极被氧化应激性状态和宫颈支原体感染病变拉伤,接着按照网站药学学筛分受到丁酸会影响CaOx肾结石的风险靶点——CYP2C9,还有按照細胞调查是因为CYP2C9在草酸盐促进的HK-2細胞ROS的水平、宫颈支原体感染病变拉伤和凋亡。这些些发觉是因为丁酸或许按照克制CYP2C9来克制CaOx肾结石的阳极被氧化应激性状态,可减轻宫颈支原体感染病变拉伤。这些全过程中拜谱菌物可以提供了网站药学学的服务于联系保障,另外拜谱菌物可增进改进改进的基因遗传组学、球脂肪酸组学、消化吸收组学等几组学货品及的服务于联系保障,热情接待联系联系! 选取论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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