
2023年4月2日,西班牙科尔多瓦大学Tomas Cerdo等人在Cell Host & Microbe(IF=30.3, 2023)杂志发表了题为“Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice”的文章。研究人员使用16S rRNA测序、宏淀粉酶质组学和代谢率组学解析揭示了婴儿认识和肠道菌群之间的联系。结果显示认识能力较好的婴儿肠道菌群可以增强小鼠的记忆,并调节了小鼠外周血皮层(PRC)的组氨酸代谢组,这些结果表明“肠脑轴”在婴儿时期就起到至关重要的作用。
英语翻译关键词:Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice (Cell Host & Microbe,IF=30.3, 2023)
简体中文关键词:婴儿肠道微生物群有助于小鼠的认知表现
组学技术应用:16S rRNA+宏蛋白质组学+代谢组学
模板资讯:婴儿粪便、小鼠粪便
探析构思
(图源:Tomas Cerdo, et al., Cell Host & Microbe. 2023)
具体研究方案效果
01、婴幼儿正确认识业务能力和肠管菌群组成的关心
首先,研究人员基于贝利婴儿发育量表(BSID-III)数据,根据6个月大的婴儿在复合认识、语言和运动三个领域的得分,将婴儿分为高于中位数组和低于中位数组。通过对婴儿粪便样本进行16S rRNA分析,发现唯一与肠道微生物群落结构密切相关的BSID-III量表是复合认识(CC)。 与少于CC中四个数组(Inf-belowCC)的新生宝宝相信,远超CC中四个数组(Inf-aboveCC)的新生宝宝胃肠菌群兼具越高的透亮性( 图1A)。在属水平上,Inf-aboveCC组的肠道菌群中杆菌、链球菌、拟副杆菌、严格感梭菌、霍氏杆菌和瘤胃球菌富集,而无毛螺科、嗜血杆菌和乳球菌的显著减少(图1B-D)。上述结果表明, 理解意识地域差异的新生婴儿,其直肠微菌物在群落格局特证上留存显著性地域差异 。
图1. Inf-aboveCC和Inf-belowCC组婴孩肠子菌微博黑名单成组成部分
02、小宝宝认识到学习能力涉及到的宏蛋白酶质组特殊性
为了探究与婴儿认识相关的肠道菌群功能特征,研究人员采用宏蛋白质组学对婴儿粪便进行分析。结果表明,Inf-belowCC组的肠道菌群富含参与细胞内运输分泌和囊泡运输的蛋白质,而Inf-aboveCC组中参与碳水化合物运输和代谢的蛋白质有增加的趋势。稀疏偏最小二乘判别分析(sPLS-DA)图显示,婴儿宏蛋白质组(图2A)和促进区分的已鉴定蛋白质组(图2B)之间存在明显区别。组氨酸酶(HutH)是Inf-aboveCC宏白质组中唯一的正相关聚集的蛋清质。随后,研究人员通过DESEq2差异丰度分析(图2C)和Wilcoxon检验进一步证实了上述结果,组氨酸分解代谢的两种下游酶尿糖酸脱水酶(HutU)和咪唑酮丙酸酶(HutI)在Inf-above CC宏蛋白质组中丰度较高。上述分析结果揭示了与婴儿认识能力相关的宏蛋白质组特征。
图2. 宏淀粉酶质组学聚集概述
03、组氨酸分解与幼儿社会认知作用关于
宏蛋白质组学数据和生化实验结果表明婴儿组氨酸代谢与认识能力相关,因此,研究人员开发一种靶点基础代谢组学方法用于定量分析组氨酸代谢物水平(图3A)。结果表明Inf-aboveCC组婴儿粪便中的尿酸盐水平显著降低,而其余组氨酸代谢物则无差异(图3B)。研究人员进一步检测了婴儿尿液中的组氨酸代谢物,结果显示与Inf-belowCC相比,Inf-aboveCC组婴儿尿液中组胺、组氨酸和尿酸水平显著升高(图3C),且Inf-aboveCC组粪便中的尿酸盐/组氨酸比值(图3D)和尿液中的组胺/尿酸盐比值(图3E)显著降低。粪便中的尿酸盐/组氨酸比值与unclass_lachnospirace_41和Lachnospiraceae incertae sedis属呈负相关,与Bacteroides_3呈正相关(图3F)。尿液中的组氨酸水平与Streptococcus_42和Bacteroides属呈正相关,而尿酸水平与Holdemanella_16呈负相关,与链球菌属呈正相关(图3G)。
图3. 组氨酸代谢率与孩子自我认同业务能力关干
04、婴幼儿供体的消化道菌群小鼠人授
最后,为了调查肠道微生物群是否有助于认知,研究人员进行了一项粪便微生物群移植(FMT)实验。结果表明,将Inf-aboveCC供体的粪便移植到GF小鼠体内,其记忆功能优于Inf-belowCC供体的小鼠(图4)。被婴儿肠道菌群定植的小鼠拥有与记忆功能相关的不同细菌分类群,认知表现较好的婴儿微生物群小鼠表现出更高的记忆功能,包括Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium物种在内的丰富分类群以及不同的组氨酸代谢组学特征(图4B),其中,毛缕菌科和拟杆菌类与婴儿认知的关联在人源化小鼠中得到了复制。此外,与接受Inf-belowCC肠道微生物组的小鼠相比,展开Inf-below cc肠内生物学学组的小鼠HutH吸附性通常会更快。总之,这些结果表明通过婴儿供体的肠道菌群粪便移植的记忆功能可以传播给GF小鼠,表明肠道菌群可以作为一种促进记忆的实体。
图4. 被新生宝宝肠管菌群定植的小鼠存在与记性功效有关的有差异细菌和病毒分为群
总结
上述情况,研发关于人员经由16S rRNA测序、宏蛋白酶质组学和排泄组学了解建设沟通了小宝宝组氨酸排泄组与自我自我认同间的沟通,存在现半个个与知道程度关于的排泄酶—组氨酸酶(HutH)。HutH平行的异同与不相同的粪液和的尿液组氨酸排泄组与小宝宝自我自我认同相相关。不仅而且,经由小宝宝供体的肠内菌群粪液种植的记忆英语特点就能够网络传播给灭菌小鼠,知道程度好些的小宝宝供体种植小鼠包含Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium等与自我自我认同程度相相关的真菌。研发体现了小宝宝软型自我自我认同和肠内菌群聊成间的相关最久在6三个月时就建设沟通开来了,组氨酸排泄物平行的缓解就是种存在的措施。拜谱工作小结
本研究通过16S rRNA测序和宏蛋白质组学分析使组氨酸酶在婴儿认识中的作用脱颖而出,并通过代谢组学和粪便移植的方法进一步验证,率先诠释了在幼儿-排泄物移值小鼠指标体系中肠腔菌群对自我认识力量的直接影响,为“肠脑轴”在幼儿晚唐时期的不断发展和效果系统打造了新的正确理解。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供蛋白质组学、代谢组学、修饰组学、16S rRNA测序等多组学技术,结合组学技术拜谱生物也推出了针对不同样本和研究领域的多组学研究方案,包括肠道篇、血液篇、医学篇等,帮助客户解决研究难题,助力多篇高分文章的发表,欢迎大家咨询!
基准论文:Tomas C, Alicia RR, Inmaculada A, et al. Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice. Cell Host & Microbe. 2023, 31(12): 1974-1988. doi: 10.1016/j.chom.2023.11.004.