
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物工程 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究分析没想到
实验工人蜡烛燃烧实验跟随着冷库用时间隔延后牛羊肉的坚硬程度、持水力发电、色调、游走于铁含量的、ROS、脂质过阳极氧化物质、MDA、GSH和GPX4层次来评估报告肩部肌肉团体血细胞核的铁生亡情况下。结杲出现,冷库用时间隔延后后,牛羊肉的坚硬程度在第5天和第6天同质性下跌;持水作用减低;彩色变深,失却有光泽,鲜色改为暗色。除外,游走于铁、可溶性氧和MDA的含量的同质性加大,血细胞核凋亡率同质性增高。 论述工人提炼不一冷冻箱日子的脂肪样机的核高血清酶,其次使用SDS-PAGE分享,核高血清酶条带在不一末期地理分布一致且类似(图1a)。选择核血清酶在不一样机中的呈现状况,分享察觉相同一条组样机的中十位数取决于于相同一条程度(图1b),表示脂肪样机核高血清酶兼备良好的的组内类似性和组间之间的关系性。 核膳食纤维组学共签别出1996种核膳食纤维。以B0为差表组,需求B1、B2、B4和B6中的核球胆固醇确定差别的描述出深入探讨,共签别到375个DEPs。将火山图大数据可视化,并跟据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05俩个原则深入探讨DEP。但是图甲1c-f一样,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别签别出22、33、73和140个DEPs,其中的分头别调整6、11、32和87个,降低16、22、41和5俩。聚类分析方法步骤评估报告了不一样的冷藏箱的阶段健身相关肌肉阻止中核膳食纤维的描述出,但是界面显示健身相关肌肉核球胆固醇描述出差别的如今吸收时的加入而加入(图1g)。
图1| 有所不同保鲜期限的肌产品的样品球营养素组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同于冷冻冷藏时候的肌肤仿品不同蛋白质分折(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁致死球蛋白肽的PRM一定量数据分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG生物富集差异化表答蛋白酶的铁死忙措施(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT降钙素原检测蛋清质组学技术性工艺的服务于,拜谱生物学已新类产品开发顺利完成并保持了不断完善旺盛期的转录组学、蛋清组学、细胞代谢组学或是多个学携手类产品技术性工艺的服务于组织体制,欢迎致电咨询!
规范文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.